Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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