Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms