Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00587B1AMM8 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms