Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms