Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IQSEC3Q9UPP2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IQSEC3Q9UPP2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms