Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSKSQ9UJT2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms