Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTSFQ9UBX1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTSFQ9UBX1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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