Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM8A1Q9UBU6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms