Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERVK-18Q9QC07 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms