Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms