Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TREX1Q9NSU2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms