Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS4Q9NQG7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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