Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB9BQ9NP90 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB9BQ9NP90 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms