Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms