Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms