Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms