Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms