Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NICN1Q9BSH3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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