Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms