Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOXF2Q9BQY4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOXF2Q9BQY4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms