Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBF4Q9BQW3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBF4Q9BQW3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms