Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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