Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms