Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms