Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms