Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDAQ92838 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDAQ92838 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms