Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBOF1Q8ND07 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms