Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMNTD2Q8IXW0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms