Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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