Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms