Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms