Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC84Q86UT8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms