Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms