Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STRADAQ7RTN6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms