Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CCBE1Q6UXH8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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