Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT10BQ6PF06 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms