Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms