Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC38Q5VT99 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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