Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms