Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms