Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HADHQ16836 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HADHQ16836 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HADHQ16836 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HADHQ16836 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HADHQ16836 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HADHQ16836 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HADHQ16836 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms