Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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