Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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NCOA1Q15788 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCOA1Q15788 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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