Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TRIP13Q15645 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP13Q15645 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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