Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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