Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3GAP1Q15042 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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