Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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