Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL19A1Q14993 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms