Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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