Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CNGB1Q14028 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CNGB1Q14028 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CNGB1Q14028 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CNGB1Q14028 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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CNGB1Q14028 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB1Q14028 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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